マトリクス組織(matrix organization)とは、ライン組織や事業部制組織のような安定性の高い「固定化された機能部門の系列」と、必要に応じて柔軟に組織される「機動性に富むプロジェクトのモジュール組織」を配置することで、各部門のバランスを確保する組織のことである。組織が複数の横軸と縦軸で構成されることで、双方の命令系統を設けるような形になる。
たとえば責任や役割において、会社組織としての専門機能遂行に対してはライン組織の長が責任を負い、随時実施されるプロジェクトに関してはプロジェクトマネジャーが責任を担うようになる。つまり、メンバーのレポーティングは機能組織へ行うものと、随時アサインされるプロジェクトに対して行うものと双方あり、レポーティングラインが交錯することが特徴でもあり、煩雑な点でもある。
常にプロジェクトベースで業務遂行がなされる、IT業界やコンサルティング業界などに多い組織形態であり、昨今のビジネス環境において、その有効性は高まっている。

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